GYIG OpenIR  > 环境地球化学国家重点实验室
基于TMT质谱分析技术筛选水稻根尖响应汞胁迫差异表达蛋白
祁忠达;  韦艳;  龙水庭;  代佑罡;  仇广乐
2019
发表期刊生态学杂志
卷号38期号:6页码:1792-1799
摘要

稻米是人群汞暴露的最主要途径之一,为了从蛋白质水平上揭示水稻(Oryza sativa L.)适应重金属汞胁迫的分子机制,本研究以拔节期金优431水稻品种为材料,对比分析对照组和50、150、300 mg·kg-1氯化汞胁迫组,采用同位素相对标记与绝对定量TMT(Tandem Mass Tag)技术,结合定量蛋白质组平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)技术,鉴定水稻根尖部位响应汞胁迫差异表达蛋白,对所获得差异蛋白进行生物信息学分析,从而筛选出汞胁迫响应显著的潜在靶标蛋白。同时,选择20个差异表达蛋白通过平行反应监测试验进行了蛋白验证。结果表明,在变化倍数≥1.3、P<0.05条件下,共鉴定5253种定量蛋白,包含364种差异蛋白,其中258种表达上调,106种表达下调。基因本体分子功能提示,这些差异性蛋白主要参与催化活性、绑定转运活性和抗氧化活性。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路显著性富集于代谢途径、次生代谢产物生物合成、苯丙烷类生物合成等,错误发现率(false discovery rate,FDR)<0.05。成功鉴定并验证到的差异蛋白分别涉及抗氧化还原蛋白、金属螯合肽合成蛋白、金属硫蛋白相关蛋白等。差异表达蛋白中,与抗氧化、重金属胁迫防御响应和信号通路等相关的蛋白总体上调,而与代谢和能量产生与转运相关蛋白表达量总体下调。

关键词水稻 蛋白组学 Tmt Prm 汞胁迫
收录类别CSCD
语种中文
引用统计
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.gyig.ac.cn/handle/42920512-1/10209
专题环境地球化学国家重点实验室
作者单位1.贵州医科大学公共卫生学院职业卫生与环境卫生学系
2.贵州医科大学环境污染与疾病监控教育部重点实验室
3.中国科学院地球化学研究所环境地球化学国家重点实验室
推荐引用方式
GB/T 7714
祁忠达;韦艳;龙水庭;代佑罡;仇广乐. 基于TMT质谱分析技术筛选水稻根尖响应汞胁迫差异表达蛋白[J]. 生态学杂志,2019,38(6):1792-1799.
APA 祁忠达;韦艳;龙水庭;代佑罡;仇广乐.(2019).基于TMT质谱分析技术筛选水稻根尖响应汞胁迫差异表达蛋白.生态学杂志,38(6),1792-1799.
MLA 祁忠达;韦艳;龙水庭;代佑罡;仇广乐."基于TMT质谱分析技术筛选水稻根尖响应汞胁迫差异表达蛋白".生态学杂志 38.6(2019):1792-1799.
条目包含的文件
文件名称/大小 文献类型 版本类型 开放类型 使用许可
基于TMT质谱分析技术筛选水稻根尖响应汞(1758KB)期刊论文作者接受稿开放获取CC BY-NC-SA浏览 请求全文
个性服务
推荐该条目
保存到收藏夹
查看访问统计
导出为Endnote文件
谷歌学术
谷歌学术中相似的文章
[祁忠达;韦艳;龙水庭;代佑罡;仇广乐]的文章
百度学术
百度学术中相似的文章
[祁忠达;韦艳;龙水庭;代佑罡;仇广乐]的文章
必应学术
必应学术中相似的文章
[祁忠达;韦艳;龙水庭;代佑罡;仇广乐]的文章
相关权益政策
暂无数据
收藏/分享
文件名: 基于TMT质谱分析技术筛选水稻根尖响应汞胁迫差异表达蛋白.pdf
格式: Adobe PDF
此文件暂不支持浏览
所有评论 (0)
暂无评论
 

除非特别说明,本系统中所有内容都受版权保护,并保留所有权利。